Скорее всего от латинского слова calc/calx "камешек". Вообще все слова, имеющие основу кальк- типа калькулятор, калькулировать, калькуляция фактически означали считать камни. Если галька - это русский вариант calc, то калькулятор можно было назвать галькулятор.
галька протославянское слово га - <тянуть вниз/воздействовать/приминать>.